33年前，JAM突然通过传送门袭击了地球。 经过多次战斗，地球军团成功击败了JAM前往仙女。 执行完任务后，零准备驾驶“雪风”返回途中，遇到了不知名的战斗机精灵。 推断零号以为是JAM，便将其击落，却因爆炸受伤……康复期间，杰克免除了零号的飞行任务，为零号的复出打开了一个小窗口。 宴会上，在醉酒的睡梦中，零看到了一些奇怪的景象……零接到了调查希尔芙的任务，但在任务期间却陷入了战斗。 他不仅遭到攻击，系统也被JAM入侵，但最终他死里逃生，回到了基地。 为了防止“雪风”落入JAM手中，杰克要求使用无人战斗机FRX接管“雪风”，却遭到了零的反对，零在争吵后不高兴地离开了。 为了查明真相，零和伙伴们私下将“雪风”号赶了出去，但后来被击落并切断了与基地的联系……这件事让杰克非常着急，他冒险前往 带着他的同事一起去军事法庭。 FRX一起出发开启搜索。 零醒来后，被告知在前线基地，一名神秘武士以修理“雪风”为借口，从零那里得到了雪风的密码。 当零看到雪风对“雪风”的警告时，立即反抗并逃离了JAM创造的数据空间。 但遭到JAM的追击，“雪风”再次被击落……就在零失望之际，雪风控制FRX前来救援，并将所有数据传输至FRX。 零号出现后，FRX“雪风”被摧毁……零号在沙漠中昏迷不醒……
