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刚从医学院毕业的穗本（笠山佑三饰），在父亲的介绍下，来到偏远农村的小石川诊所实习。他的老师是一位名叫红胡子的古怪医生（三船敏郎饰）。起初，向往长崎的宝本讨厌这个贫民窟，并激怒了红胡子，觉得他被欺骗了，没用。红胡子是这里著名的杏林高手。他没有对保本提出任何要求，而是默默行医，不畏强权，不计报酬，手下治愈了无数病人，其中包括一名因虐待而精神失常的年轻女子（香川杏子香川饰），酗酒导致身体麻木的酒鬼，被拐卖到妓院后患性病的年轻妓女等等。在协助红胡子救死扶伤的过程中，宝本逐渐发现医德的重要性，并修正了自己的人生态度……
