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故事发生在东京八丈岛的海洋中，那里建造了一个海洋设施，连接来自世界各地的警察监控摄像头。 在该设备正式上线之前，来自世界各地的IT工程师来到现场，以便连接到欧洲刑警组织管辖的区域。 与此同时，一项利用人脸识别系统的测试也在进行中…… 另一方面，柯南和少年侦探团在园子的热情招待下前往八丈岛观鲸。 这时，柯南接到大木耀（赤井秀一饰）的电话，得知欧洲刑警组织成员在德国被金酒强奸。 为了调查真相，柯南偷偷潜入黑田平等警视厅人员准备执行警戒工作的警戒船，进入设施内。 随后，正在稳步启动系统启动准备工作的设施内发生了一起案件——一名女性项目被黑色组织绑架，她手中含有部分信息的U盘也落入了黑色组织手中。 里面。 海里传来螺旋桨的怪异声音。 这时，八丈岛上的灰原爱，有一道黑影悄然逼近……
