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市立见泷原中学又迎来了安静、平静、祥和的一天。 二年级女生鹿目圆(结城爱 配音)和好友吉树早香(北村惠理 配音)、志月仁(新谷凉子 配音)一起畅谈爱情话题,享受少女的快乐青春。 这时,班里转来了一位名叫小美妍(斋藤千和 配音)的新学生。 这个气质有些神秘的女孩让小圆有些疑惑。 在和沙耶香放学回家的路上,小圆听到了呼救声。 声音来自一个全身伤痕累累的未知生物,正是追赶它的晓焰。 关键时刻,他们得到了同为御泷原中学学生的魔法少女巴真美(水桥香织 配音)的帮助,并得知了名为久兵卫的生物拥有帮助人们成为魔法少女的能力。 女孩们无意中打开了另一个世界的大门。 这部电影是《魔法少女》的剧场版。 该剧分三部上映,由TV版的12集重新剪辑而成。